Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC10P48553 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAPPC10P48553 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC10P48553 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms