Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCLCP48506 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLCP48506 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLCP48506 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLCP48506 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLCP48506 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLCP48506 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLCP48506 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLCP48506 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLCP48506 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCLCP48506 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCLCP48506 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLCP48506 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLCP48506 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLCP48506 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLCP48506 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLCP48506 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLCP48506 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLCP48506 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLCP48506 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCLCP48506 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCLCP48506 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCLCP48506 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
GCLCP48506 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCLCP48506 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLCP48506 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLCP48506 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLCP48506 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLCP48506 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLCP48506 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLCP48506 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLCP48506 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLCP48506 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLCP48506 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GCLCP48506 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCLCP48506 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms