Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP13P45452 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP13P45452 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP13P45452 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP13P45452 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP13P45452 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP13P45452 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP13P45452 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP13P45452 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP13P45452 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP13P45452 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP13P45452 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP13P45452 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP13P45452 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP13P45452 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP13P45452 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP13P45452 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP13P45452 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP13P45452 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP13P45452 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP13P45452 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP13P45452 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP13P45452 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP13P45452 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP13P45452 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP13P45452 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms