Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNT3P45378 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNNT3P45378 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms