Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIA1P42261 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms