Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEACAM3P40198 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms