Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 TWF1YGR080W 999 nt4.7□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 RPL17BYJL177W 555 nt4.7□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YJR085CYJR085C 318 nt4.7□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YKL070WYKL070W 510 nt4.7□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YLR224WYLR224W 1110 nt4.7□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YBL010CYBL010C 843 nt4.7□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 RPS1BYML063W 768 nt4.7□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 ASI2YNL159C 870 nt4.7□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 SPN1YPR133C 1233 nt4.7□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 PSE1YMR308C 3270 nt4.7□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 SEC39YLR440C 2130 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 ASI3YNL008C 2031 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 ALD3YMR169C 1521 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 LHP1YDL051W 828 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 AIM7YDR063W 450 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 CNL1YDR357C 369 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 PET54YGR222W 882 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 RSM25YIL093C 795 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 REE1YJL217W 597 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 MIM2YLR099W-A 264 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 POP3YNL282W 588 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 RPL18BYNL301C 561 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 THI12YNL332W 1023 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 DDP1YOR163W 567 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 MSS18YPR134W 807 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 KRE6YPR159W 2163 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 CAF4YKR036C 1932 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 SKO1YNL167C 1944 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 SAP155YFR040W 3009 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 NDC1YML031W 1968 nt4.69□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 MNT2YGL257C 1677 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 HOM2YDR158W 1098 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YDR366CYDR366C 399 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YEL067CYEL067C 588 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 SCS2YER120W 735 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 MCR1YKL150W 909 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YLL044WYLL044W 447 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YLR125WYLR125W 411 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 FLD1YLR404W 858 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YPR050CYPR050C 414 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YCL012CYCL012C 405 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 SDS23YGL056C 1584 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 TPD3YAL016W 1908 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 SNF3YDL194W 2655 nt4.68□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YAP1YML007W 1953 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 CTR86YCR054C 1692 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 PAN1YIR006C 4443 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 MUD2YKL074C 1584 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 CDC50YCR094W 1176 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 FAD1YDL045C 921 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 RPL27BYDR471W 411 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 LSB1YGR136W 726 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 UBI4YLL039C 1146 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 CMC2YBL059C-A 330 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YOR053WYOR053W 342 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 FYV5YCL058C 459 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 HIS4YCL030C 2400 nt4.67□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 BOI2YER114C 3123 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 DSL1YNL258C 2265 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 SMP3YOR149C 1551 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YPS7YDR349C 1791 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 CTM1YHR109W 1758 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 SWF1YDR126W 1011 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 ARG82YDR173C 1068 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YER034WYER034W 558 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 TDA2YER071C 381 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 GOS1YHL031C 672 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 PRS5YOL061W 1491 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 AFT1YGL071W 2073 nt4.66□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 CDC40YDR364C 1368 nt4.65□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 FAR8YMR029C 1572 nt4.65□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YKR078WYKR078W 1758 nt4.65□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 CRT10YOL063C 2874 nt4.65□□□□□ -1.66
YAR028WP39548 YER135CYER135C 393 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 YAP3YHL009C 993 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 YJR038CYJR038C 363 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 NNF1YJR112W 606 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 ENT3YJR125C 1227 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 CTK3YML112W 891 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 TIF11YMR260C 462 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 DYN3YMR299C 939 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 YBR285WYBR285W 435 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 LYS2YBR115C 4179 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 PPN1YDR452W 2025 nt4.65□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 MSE1YOL033W 1611 nt4.64□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 STE20YHL007C 2820 nt4.64□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 UBP10YNL186W 2379 nt4.64□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 CDC9YDL164C 2268 nt4.64□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 YMR018WYMR018W 1545 nt4.64□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 ADY2YCR010C 852 nt4.64□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 LPP1YDR503C 825 nt4.64□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 SPT2YER161C 1002 nt4.64□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 MAK16YAL025C 921 nt4.64□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 AIM29YKR074W 468 nt4.64□□□□□ -1.67
YAR028WP39548 YNL150WYNL150W 408 nt4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.8 ms