Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4A3P38919 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF4A3P38919 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms