Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
DDIT3P35638 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms