Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDXP35241 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDXP35241 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDXP35241 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDXP35241 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDXP35241 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RDXP35241 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDXP35241 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDXP35241 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDXP35241 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDXP35241 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDXP35241 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RDXP35241 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDXP35241 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDXP35241 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDXP35241 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDXP35241 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDXP35241 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDXP35241 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDXP35241 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDXP35241 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDXP35241 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDXP35241 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDXP35241 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDXP35241 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDXP35241 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDXP35241 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDXP35241 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDXP35241 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDXP35241 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDXP35241 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDXP35241 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RDXP35241 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDXP35241 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDXP35241 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDXP35241 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDXP35241 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDXP35241 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDXP35241 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDXP35241 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RDXP35241 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDXP35241 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDXP35241 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDXP35241 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDXP35241 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms