Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSPA4P34932 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HSPA4P34932 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms