Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD1P33897 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms