Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG3P32926 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DSG3P32926 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG3P32926 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG3P32926 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG3P32926 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG3P32926 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG3P32926 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG3P32926 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG3P32926 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG3P32926 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG3P32926 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG3P32926 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG3P32926 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG3P32926 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG3P32926 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG3P32926 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG3P32926 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG3P32926 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG3P32926 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG3P32926 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG3P32926 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG3P32926 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG3P32926 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG3P32926 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG3P32926 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG3P32926 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG3P32926 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG3P32926 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG3P32926 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG3P32926 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG3P32926 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG3P32926 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG3P32926 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG3P32926 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG3P32926 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG3P32926 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG3P32926 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG3P32926 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG3P32926 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG3P32926 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG3P32926 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms