Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTX1P32242 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTX1P32242 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTX1P32242 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTX1P32242 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTX1P32242 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX1P32242 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms