Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD1P28340 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD1P28340 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD1P28340 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD1P28340 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD1P28340 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD1P28340 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLD1P28340 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLD1P28340 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD1P28340 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD1P28340 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD1P28340 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD1P28340 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD1P28340 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD1P28340 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD1P28340 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLD1P28340 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD1P28340 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD1P28340 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD1P28340 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD1P28340 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD1P28340 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD1P28340 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD1P28340 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD1P28340 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD1P28340 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLD1P28340 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLD1P28340 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLD1P28340 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD1P28340 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD1P28340 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD1P28340 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD1P28340 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD1P28340 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLD1P28340 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD1P28340 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD1P28340 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD1P28340 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD1P28340 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD1P28340 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD1P28340 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD1P28340 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD1P28340 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD1P28340 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD1P28340 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLD1P28340 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLD1P28340 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLD1P28340 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLD1P28340 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLD1P28340 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLD1P28340 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLD1P28340 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLD1P28340 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLD1P28340 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLD1P28340 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLD1P28340 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLD1P28340 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLD1P28340 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLD1P28340 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLD1P28340 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLD1P28340 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLD1P28340 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLD1P28340 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms