Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXP28300 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXP28300 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXP28300 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXP28300 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXP28300 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXP28300 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXP28300 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LOXP28300 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LOXP28300 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LOXP28300 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LOXP28300 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LOXP28300 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LOXP28300 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXP28300 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXP28300 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXP28300 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXP28300 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXP28300 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXP28300 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXP28300 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms