Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HTR2AP28223 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HTR2AP28223 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms