Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBB3P26998 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms