Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
NFKBIAP25963 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKBIAP25963 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms