Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPAP23025 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPAP23025 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPAP23025 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XPAP23025 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XPAP23025 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XPAP23025 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPAP23025 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPAP23025 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPAP23025 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPAP23025 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPAP23025 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPAP23025 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPAP23025 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPAP23025 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPAP23025 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XPAP23025 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPAP23025 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPAP23025 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPAP23025 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPAP23025 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPAP23025 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPAP23025 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPAP23025 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
XPAP23025 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPAP23025 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPAP23025 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPAP23025 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPAP23025 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
XPAP23025 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPAP23025 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPAP23025 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPAP23025 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPAP23025 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPAP23025 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms