Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCP2P22307 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCP2P22307 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCP2P22307 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCP2P22307 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCP2P22307 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCP2P22307 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCP2P22307 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCP2P22307 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCP2P22307 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms