Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB4AP20338 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms