Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNA2P20248 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNA2P20248 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms