Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL2P19875 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CXCL2P19875 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms