Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC3P19447 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC3P19447 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms