Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD58P19256 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD58P19256 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD58P19256 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD58P19256 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD58P19256 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD58P19256 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD58P19256 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD58P19256 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD58P19256 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD58P19256 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD58P19256 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD58P19256 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD58P19256 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD58P19256 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD58P19256 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD58P19256 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms