Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VCLP18206 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VCLP18206 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VCLP18206 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VCLP18206 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VCLP18206 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VCLP18206 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VCLP18206 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VCLP18206 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms