Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPCAMP16422 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPCAMP16422 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms