Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME1P15531 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME1P15531 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NME1P15531 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME1P15531 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME1P15531 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME1P15531 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME1P15531 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NME1P15531 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms