Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXB3P14651 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXB3P14651 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms