Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFTRP13569 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CFTRP13569 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFTRP13569 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFTRP13569 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFTRP13569 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFTRP13569 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CFTRP13569 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFTRP13569 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFTRP13569 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CFTRP13569 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CFTRP13569 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CFTRP13569 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CFTRP13569 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CFTRP13569 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
CFTRP13569 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CFTRP13569 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CFTRP13569 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CFTRP13569 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CFTRP13569 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CFTRP13569 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CFTRP13569 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CFTRP13569 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
CFTRP13569 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CFTRP13569 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CFTRP13569 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CFTRP13569 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CFTRP13569 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFTRP13569 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFTRP13569 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFTRP13569 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFTRP13569 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFTRP13569 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFTRP13569 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFTRP13569 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFTRP13569 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFTRP13569 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CFTRP13569 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CFTRP13569 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CFTRP13569 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CFTRP13569 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CFTRP13569 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CFTRP13569 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CFTRP13569 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CFTRP13569 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CFTRP13569 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CFTRP13569 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CFTRP13569 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CFTRP13569 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CFTRP13569 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CFTRP13569 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CFTRP13569 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
CFTRP13569 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CFTRP13569 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CFTRP13569 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CFTRP13569 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
CFTRP13569 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CFTRP13569 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CFTRP13569 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CFTRP13569 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CFTRP13569 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CFTRP13569 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.5
CFTRP13569 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CFTRP13569 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms