Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RLBP1P12271 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RLBP1P12271 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms