Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1P11387 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1P11387 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1P11387 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1P11387 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1P11387 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1P11387 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1P11387 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1P11387 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1P11387 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1P11387 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1P11387 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1P11387 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1P11387 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOP1P11387 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOP1P11387 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1P11387 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1P11387 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1P11387 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1P11387 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1P11387 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1P11387 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1P11387 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1P11387 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1P11387 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1P11387 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1P11387 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1P11387 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1P11387 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms