Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGAMP11215 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGAMP11215 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms