Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HKR1P10072 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HKR1P10072 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HKR1P10072 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HKR1P10072 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HKR1P10072 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HKR1P10072 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms