Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI3P10071 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI3P10071 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI3P10071 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI3P10071 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI3P10071 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GLI3P10071 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GLI3P10071 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GLI3P10071 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI3P10071 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI3P10071 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI3P10071 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI3P10071 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI3P10071 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLI3P10071 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI3P10071 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI3P10071 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI3P10071 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI3P10071 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI3P10071 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI3P10071 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI3P10071 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI3P10071 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI3P10071 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI3P10071 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI3P10071 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI3P10071 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI3P10071 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI3P10071 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI3P10071 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI3P10071 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI3P10071 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI3P10071 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI3P10071 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI3P10071 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI3P10071 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI3P10071 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI3P10071 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI3P10071 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI3P10071 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI3P10071 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI3P10071 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI3P10071 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI3P10071 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI3P10071 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI3P10071 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GLI3P10071 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GLI3P10071 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GLI3P10071 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GLI3P10071 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GLI3P10071 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GLI3P10071 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GLI3P10071 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GLI3P10071 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GLI3P10071 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI3P10071 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLI3P10071 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms