Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGKV1-13P0DP09 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGKV1-13P0DP09 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms