Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD3P0DMS9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms