Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SETSIPP0DME0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SETSIPP0DME0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms