Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAA2P0DJI9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SAA2P0DJI9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms