Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RD3LP0DJH9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms