Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM228BP0C875 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM228BP0C875 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms