Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLA1P09884 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLA1P09884 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
POLA1P09884 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
POLA1P09884 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
POLA1P09884 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
POLA1P09884 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
POLA1P09884 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
POLA1P09884 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
POLA1P09884 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
POLA1P09884 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC35.95■■■■□ 3.35
POLA1P09884 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
POLA1P09884 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLA1P09884 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLA1P09884 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLA1P09884 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLA1P09884 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLA1P09884 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLA1P09884 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLA1P09884 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLA1P09884 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLA1P09884 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
POLA1P09884 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
POLA1P09884 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
POLA1P09884 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
POLA1P09884 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
POLA1P09884 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
POLA1P09884 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
POLA1P09884 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
POLA1P09884 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLA1P09884 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLA1P09884 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLA1P09884 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLA1P09884 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
POLA1P09884 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLA1P09884 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLA1P09884 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLA1P09884 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLA1P09884 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
POLA1P09884 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLA1P09884 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLA1P09884 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLA1P09884 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLA1P09884 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLA1P09884 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLA1P09884 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLA1P09884 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLA1P09884 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLA1P09884 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLA1P09884 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLA1P09884 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
POLA1P09884 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLA1P09884 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLA1P09884 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLA1P09884 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLA1P09884 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
POLA1P09884 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
POLA1P09884 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
POLA1P09884 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
POLA1P09884 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
POLA1P09884 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
POLA1P09884 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
POLA1P09884 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
POLA1P09884 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
POLA1P09884 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLA1P09884 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
POLA1P09884 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
POLA1P09884 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
POLA1P09884 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
POLA1P09884 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
POLA1P09884 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
POLA1P09884 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
POLA1P09884 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
POLA1P09884 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
POLA1P09884 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms