Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTBP09497 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTBP09497 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTBP09497 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTBP09497 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLTBP09497 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLTBP09497 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLTBP09497 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTBP09497 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTBP09497 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTBP09497 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLTBP09497 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTBP09497 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTBP09497 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTBP09497 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTBP09497 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTBP09497 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTBP09497 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTBP09497 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTBP09497 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTBP09497 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTBP09497 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTBP09497 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTBP09497 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTBP09497 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms