Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD48P09326 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD48P09326 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD48P09326 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD48P09326 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD48P09326 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD48P09326 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD48P09326 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD48P09326 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD48P09326 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD48P09326 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD48P09326 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD48P09326 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD48P09326 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD48P09326 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD48P09326 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD48P09326 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD48P09326 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD48P09326 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD48P09326 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD48P09326 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD48P09326 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD48P09326 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms