Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSLP07711 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSLP07711 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSLP07711 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSLP07711 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTSLP07711 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTSLP07711 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSLP07711 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSLP07711 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSLP07711 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSLP07711 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSLP07711 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTSLP07711 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTSLP07711 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms