Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-DOAP06340 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DOAP06340 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms