Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB1P05937 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB1P05937 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB1P05937 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB1P05937 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB1P05937 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB1P05937 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB1P05937 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALB1P05937 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALB1P05937 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB1P05937 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB1P05937 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB1P05937 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB1P05937 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB1P05937 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB1P05937 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB1P05937 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB1P05937 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB1P05937 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALB1P05937 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALB1P05937 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALB1P05937 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALB1P05937 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALB1P05937 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALB1P05937 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALB1P05937 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALB1P05937 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CALB1P05937 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALB1P05937 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALB1P05937 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALB1P05937 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALB1P05937 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALB1P05937 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALB1P05937 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALB1P05937 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALB1P05937 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALB1P05937 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALB1P05937 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALB1P05937 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALB1P05937 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALB1P05937 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALB1P05937 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALB1P05937 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms