Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERPIND1P05546 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SERPIND1P05546 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms