Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3DP05423 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3DP05423 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms